他說,長江流域工業化、城市化進程較快,但環境基礎設施建設總體滯后,工業結構性污染問題比較突出,種植業、畜禽養殖業、水產養殖業等面源污染問題比較嚴重,污染物排放總量總體較高;化工等重污染企業沿江布局的現象十分普遍,工業園區密布,部分企業違法排污、超標排污的現象依然存在,部分地區重金屬污染問題比較突出,飲用水源取水口和排污口交叉分布、水運航道穿過飲用水水源保護區的現象較多,危險化學品船舶運輸比較普遍,流域水環境隱患依然突出。
萬本太認為,在加快發展的同時,長江流域的環境保護工作仍需加強,要進一步將環境保護融入經濟社會發展的全過程,將環境保護作為優化經濟增長、轉變發展方式的重要手段。